Situé dans le sud de l’Alsace, dans une région surnommée le Sundgau.
Helfrantzkirch, avec une altitude de 380 mètres est le plus haut village du pays de Sierentz (chef lieu du canton). La commune s’étend sur une superficie de 623 hectares.

Helfrantzkirch se trouve à 25 km de Mulhouse, la seconde ville la plus importante d’Alsace et à 12 km de Saint-Louis. Sa proximité à l’Euro-Airport (Bâle-Mulhouse-Freiburg), situé sur la commune de Blotzheim, lui procure une accessibilité à toutes les plus grandes villes européennes.